Sekolah Tinggi Agama Islam (STAI) Baitul Arqom Al-Islami pada mulanya bernama Sekolah Tinggi Il;mu Syari’ah (STIS) yang didirikan pada tanggal 22 Juni 1986 oleh Yayasan Ma’had Baitul Arqom Al-Islami, Satu tahun kemudian tepatnya tanggal 22 Juni 1987 Yayasan Ma’had Baitul Arqom mendirikan Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah (STIT) Pada saat itu juga Yayasan mengajukkan proposal izin penyelenggaraan kedua program studi tersebut kepada Menteri Agama, namun yang diterima dan memenuhi persyaratan adalah Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah (STIT). Dengan Surat Keputusan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 239 tanggal 26 September 1991. Pada tahun 1993 terjadi perubahan struktur pimpinan sehubungan terbitnya keputusan menteri agama yang menyatakan ketua yayasan tidak boleh rangkap jabatan dengan ketua sekolah tinggi Sesuai peraturan yang berlaku pada tahun 1994, nama STIT berubah lagi menjadi STAI.
Hal ini berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor: 461 tahun 1996 tanggal 30 September tahun 1996 tentang perubahan nama dan penetapan kembali Status Terdaftar Program Strata Satu ( S1 ) Jurusan Pendidikan Agama Islam Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah ( STIT ) Baitul Arqom Al-Islami Ciparay Bandung menjadi Jurusan Pendidikan Agama Islam ( Tarbiyah ) Sekolah Tinggi Agama Islam ( STAI ) Baitul Arqom Al-Islami Ciparay Bandung serta Pemberian Status Terdaftar Strata Satu ( S1 ) Jurusan Ahwal Al-Syakhsyiyyah ( Syari’ah ) Sekolah Tinggi Agama Islam ( STAI ) Baitul Arqom Al-Islami Ciparay Bandung.
Pada saat ini STAI masih satu program studi yang aktif dan berjalan Yakni jurusan Pendidikan Guru Madrasah ibdtidaiyah (Tarbiyah) yang baru terbit 2024